Descrizione dell’attività di ricerca
Negli ultimi vent’anni la ricerca nel campo delle Scienze della Vita ha vissuto una rivoluzione con lo sviluppo delle tecnologie di produzione massiva di dati che hanno reso possibile la caratterizzazione dei meccanismi ad una scala globale, prima impensabile. Nell’arco degli anni sono state sviluppate moltissime applicazioni del sequenziamento: per la localizzazione di proteine, l’identificazione di mutazioni, la caratterizzazione del trascrittoma e del profilo di espressione dei geni, lo stato di accessibilità della cromatina ed interazioni tra regioni cromosomiche, lo stato della metilazione e nuove tecnologie cosiddette omiche vengono continuamente sviluppate. La Bioinformatica e la Biologia Computazionale hanno il ruolo di affrontare questa complessità per produrre risultati interpretabili e porre nuove domande e modelli nella descrizione dei meccanismi a livello molecolare. L’attività di ricerca include l’analisi, integrazione e interpretazione dei dati con lo sviluppo di nuovi strumenti e metodi allo stato dell’arte, utilizzando standard internazionali e risorse di calcolo ad alte prestazioni. Oltre all’analisi dei singoli dataset, particolare interesse è rivolto alla loro integrazione per trovare nuovi livelli di connessioni tra i dati, per delucidare le reti di regolazione tra geni, nell’interpretazione dell’effetto di varianti geniche nel contesto di malattie genetiche rare e di tumori.
Personale coinvolto
Collaborazioni Nazionali ed Internazionali
- Istituto di tecnologie biomediche (ITB), CNR;
- Istituto di calcolo e reti ad alte prestazioni (ICAR), CNR;
- Istituto per le applicazioni del calcolo (IAC), CNR;
- Istituto di Biochimica e Biologia Cellulare (IBBC), CNR;
- Università della Campania “Luigi Vanvitelli”;
- UniversitĂ degli Studi di Napoli Federico II;
- Telethon Institute of Genetics and Medicine (TIGEM);
- Istituto di Oncologia Molecolare (IFOM).